一元過氧乙酸殺菌主要依靠自身強大的氧化能力，通過氧化作用使酶失去活性，導致微生物死亡。此外，過氧化氫和乙酸協同作用，可改變細胞內的酸堿度從而損傷微生物。

空氣或物體表面消毒

一元過氧乙酸不會腐蝕電梯、汽車、門把手、扶手等不銹鋼配件。適用范圍廣泛，可廣譜殺毒。

本品有一定腐蝕性，可能會造成皮膚短暫變白，使用時請佩戴橡膠手套，避免接觸眼睛和皮膚。若不慎接觸，應立即用大量清水沖洗，如有不適，請立即就醫。